Мир захлестнула волна хаоса. Таинственная организация «Кронос» привела в действие «Проект Гекигангер» — технологию, позволяющую создавать идеальных двойников людей, наделенных всеми их воспоминаниями, навыками и даже внешностью. Эти копии, лишенные моральных ограничений, начинают методично заменять ключевых фигур в политике, экономике и военных структурах, превращая их в марионеток. Обычные люди не замечают подмены, пока однажды группа из трех совершенно разных подростков — бывший гений-программист, уличный боец и девушка с феноменальной интуицией — не сталкиваются с собственными двойниками. Выжив в первой схватке, они понимают: их копии не просто сильнее, они знают каждую их слабость, каждую мысль. Чтобы выжить, троице приходится объединиться, создав импровизированный отряд «Гекигангер-3», и вступить в партизанскую войну против невидимого врага, где нельзя верить никому, даже собственному отражению.
С каждым боем герои обнаруживают, что «Кронос» не просто захватывает власть — они переписывают саму реальность, стирая оригиналы и заменяя их послушными копиями. Проблема усугубляется, когда выясняется, что один из членов команды сам является несовершенным двойником, чьи воспоминания начали давать сбои. Доверие рушится, паранойя пронизывает каждый шаг, а времени на разбирательства нет: «Кронос» запускает финальную фазу плана, способную стереть грань между оригиналом и подделкой навсегда. Отчаянная гонка приводит героев в сердце вражеской базы, где их ждет шокирующее открытие — создатель технологии, гениальный ученый, уже давно заменил самого себя, и теперь его копия, лишенная жалости, управляет всем процессом. Финальная битва превращается в зеркальный лабиринт, где каждый удар может быть нанесен по другу, а последний выбор — сохранить человечность или стать тем, кого ненавидишь — определит судьбу не только их троих, но и всего мира, балансирующего на грани полной подмены.
