В мире, где магия переплелась с технологией, а небеса бороздят дирижабли, раскинулась Яблочная Страна — континент, разделенный на двенадцать королевств, каждое из которых хранит тайну своего процветания. В центре этого мира возвышается Древо Жизни, дарующее магические яблоки, способные исцелять любые раны и продлевать жизнь. Но идиллия рушится, когда на земли обрушивается загадочная болезнь, превращающая людей в каменные статуи. Юный механик по имени Асахи, живущий в захолустном городке, теряет в этой эпидемии свою сестру. Отчаявшись найти лекарство, он случайно находит древний артефакт — говорящий амулет, который указывает ему путь к легендарному Алхимику, якобы создавшему первое яблоко. Вместе с дерзкой пираткой-изобретательницей Лин и бывшим рыцарем-отшельником Гару, Асахи отправляется в опасное путешествие через враждующие королевства, чтобы отыскать источник чумы.
Их путь пролегает через парящие острова, кишащие механическими монстрами, и подземные города, где правят кланы некромантов. Постепенно герои понимают, что каменная болезнь — не случайность, а результат древнего заговора, в котором замешаны правители двенадцати королевств. Каждый из них втайне использует яблоки Древа Жизни для личной выгоды, нарушая хрупкий баланс мира. Асахи предстоит не только собрать ключи от запретной библиотеки Алхимика, но и сделать невозможный выбор: спасти сестру, пожертвовав будущим всего континента, или найти способ разрушить порочный круг, не уничтожив последнюю надежду. В финале выясняется, что истинная сила яблок не в исцелении, а в принятии неизбежного — и только отказавшись от эгоистичных желаний, герои смогут остановить лавину разрушений, запущенную их собственными предками.